Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll13A4Q9F6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms