Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll9A2APC3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms