Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam209A2APA5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms