Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Fam43bA2AM80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam43bA2AM80 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms