Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn3A2ALK8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms