Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms