Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms