Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms