Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5538W4VSP6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms