Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib2Q9Z309 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cib2Q9Z309 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib2Q9Z309 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms