Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2911 ms