Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn6Q9Z262 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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