Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RfxankQ9Z205 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RfxankQ9Z205 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms