Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VarsQ9Z1Q9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms