Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms