Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn10Q9Z0S6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn10Q9Z0S6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn10Q9Z0S6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms