Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms