Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scnn1gQ9WU39 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms