Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrf1Q9WU00 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms