Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd4Q9QY39 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd4Q9QY39 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms