Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms