Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxe3Q9QY14 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxe3Q9QY14 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms