Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms