Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms