Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrfQ9JM73 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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