Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SigirrQ9JLZ8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SigirrQ9JLZ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms