Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefQ9JLC6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefQ9JLC6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms