Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms