Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms