Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp4Q9JIL5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms