Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms