Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EefsecQ9JHW4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EefsecQ9JHW4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms