Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms