Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Rapgef4Q9EQZ6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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