Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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