Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms