Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmbim4Q9DA39 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms