Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp12Q9D9M2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp12Q9D9M2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp12Q9D9M2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms