Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms