Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clic3Q9D7P7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clic3Q9D7P7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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