Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms