Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabl3Q9D4V7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms