Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms