Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms