Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Katnal2Q9D3R6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms