Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms