Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim42Q9D2H5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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