Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms