Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl53Q9D1H8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms