Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ube2cQ9D1C1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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